Merimiehenkotimuseo sijaitsee Oulun vanhimmassa puurakennuksessa, joka tunnetaan myös nimellä Matilan talo. Talossa on aikoinaan toiminut Limingantullin tullitupa ja sen historia juontaa 1700-luvulle. Rakennus sijaitsi alunperin Kirkko- ja Nummikadun kulmassa (nyk. Kirkkokatu 38).

Limingan Osuuskaupan meijerin maitokauppana vuonna 1934.
 

Vuonna 1983 Limingantullin entinen tullitupa purettiin ja kuljetettiin Oulun Pikisaareen uudelleen pystytettäväksi. Rakennus siirtyi Pohjois-Pohjanmaan museon hallintaan ja se sisustettiin 1880-luvun merimiehen kodiksi merimies Isak Matilaisen mukaan. Museossa on esillä oululaiseen merimiehen kotiin 1800-luvun loppupuolella tyypillisesti kuuluneita huonekaluja ja esineitä.

Ennen vanhaan merimiesten tyypillisiin matkatuliaisiin kuuluivat Englannista ostetut posliinikoirat. Ikkunalaudalle sijoitettu koirapari viestitti ulkopuolisille talon isännän liikkeistä. Jos perheenpää purjehti merillä, koirat katsoivat ikkunasta ulos. Jos taas isäntä oli kotosalla, koirat tuijottivat sisälle huoneeseen. Koirien asennosta naapurit ja muut kulkijat tiesivät, oliko talon isäntä saanut pestin laivaan vai ei.